Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0Y1

Tgif2, Homeobox protein TGIF2, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgif2Q8C0Y1 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tgif2Q8C0Y1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgif2Q8C0Y1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgif2Q8C0Y1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgif2Q8C0Y1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgif2Q8C0Y1 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgif2Q8C0Y1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgif2Q8C0Y1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgif2Q8C0Y1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgif2Q8C0Y1 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tgif2Q8C0Y1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgif2Q8C0Y1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgif2Q8C0Y1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgif2Q8C0Y1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgif2Q8C0Y1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgif2Q8C0Y1 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgif2Q8C0Y1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgif2Q8C0Y1 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgif2Q8C0Y1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgif2Q8C0Y1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tgif2Q8C0Y1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms