Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccser1Q8C0C4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccser1Q8C0C4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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