Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Snx16Q8C080 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx16Q8C080 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx16Q8C080 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx16Q8C080 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx16Q8C080 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Snx16Q8C080 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx16Q8C080 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx16Q8C080 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Snx16Q8C080 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx16Q8C080 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx16Q8C080 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Snx16Q8C080 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Snx16Q8C080 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Snx16Q8C080 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Snx16Q8C080 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx16Q8C080 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx16Q8C080 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx16Q8C080 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx16Q8C080 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx16Q8C080 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx16Q8C080 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx16Q8C080 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx16Q8C080 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx16Q8C080 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx16Q8C080 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx16Q8C080 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx16Q8C080 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx16Q8C080 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx16Q8C080 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx16Q8C080 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx16Q8C080 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx16Q8C080 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Snx16Q8C080 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Snx16Q8C080 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms