Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp47Q8BY87 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp47Q8BY87 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms