Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXQ3

Lrtm1, Leucine-rich repeat and transmembrane domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrtm1Q8BXQ3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Lrtm1Q8BXQ3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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