Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXJ2

Trerf1, Transcriptional-regulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trerf1Q8BXJ2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Trerf1Q8BXJ2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Trerf1Q8BXJ2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms