Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ube3dQ8BX13 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
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