Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rbbp5Q8BX09 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms