Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
Ctdsp2Q8BX07 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
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