Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW22

Ss18l1, Calcium-responsive transactivator, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l1Q8BW22 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ss18l1Q8BW22 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
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Ss18l1Q8BW22 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ss18l1Q8BW22 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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