Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pdcl3Q8BVF2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms