Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV13

Cops7b, COP9 signalosome complex subunit 7b, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops7bQ8BV13 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cops7bQ8BV13 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms