Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUM9

Usp43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp43Q8BUM9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usp43Q8BUM9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms