Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU7

Rccd1, RCC1 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rccd1Q8BTU7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 1110059E24Rik-205ENSMUST00000178523 629 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rccd1Q8BTU7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms