Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Nup54Q8BTS4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Nup54Q8BTS4 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms