Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Prpf18Q8BM39 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Prpf18Q8BM39 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Prpf18Q8BM39 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Prpf18Q8BM39 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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