Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Cyp4f39Q8BGU0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms