Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BGC1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BGC1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Q8BGC1 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BGC1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Q8BGC1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
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