Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW5

H2-M10.6, Histocompatibility 2, M region locus 10.6, mousemouse

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.6Q85ZW5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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H2-M10.6Q85ZW5 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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H2-M10.6Q85ZW5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
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H2-M10.6Q85ZW5 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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H2-M10.6Q85ZW5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
H2-M10.6Q85ZW5 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
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