Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

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Length 664 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ChfrQ810L3 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ChfrQ810L3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ChfrQ810L3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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ChfrQ810L3 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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ChfrQ810L3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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ChfrQ810L3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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ChfrQ810L3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ChfrQ810L3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ChfrQ810L3 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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ChfrQ810L3 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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