Protein–RNA interactions for Protein: Q80YR6

Rbbp8, DNA endonuclease RBBP8, mousemouse

Predictions only

Length 893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8Q80YR6 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rbbp8Q80YR6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rbbp8Q80YR6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms