Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Atg2bQ80XK6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms