Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Pcsk9Q80W65 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
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Pcsk9Q80W65 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcsk9Q80W65 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcsk9Q80W65 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Pcsk9Q80W65 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pcsk9Q80W65 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Pcsk9Q80W65 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Pcsk9Q80W65 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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Pcsk9Q80W65 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
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Pcsk9Q80W65 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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Pcsk9Q80W65 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Pcsk9Q80W65 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Pcsk9Q80W65 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcsk9Q80W65 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcsk9Q80W65 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcsk9Q80W65 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pcsk9Q80W65 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcsk9Q80W65 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pcsk9Q80W65 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms