Protein–RNA interactions for Protein: Q80VN0

Cfap100, Cilia- and flagella-associated protein 100, mousemouse

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap100Q80VN0 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cfap100Q80VN0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cfap100Q80VN0 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cfap100Q80VN0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cfap100Q80VN0 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cfap100Q80VN0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cfap100Q80VN0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cfap100Q80VN0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cfap100Q80VN0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cfap100Q80VN0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cfap100Q80VN0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cfap100Q80VN0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cfap100Q80VN0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cfap100Q80VN0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cfap100Q80VN0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms