Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Pnma8aQ80VM8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms