Protein–RNA interactions for Protein: Q80UU2

Rpp38, Ribonuclease P protein subunit p38, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpp38Q80UU2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpp38Q80UU2 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpp38Q80UU2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms