Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG8

Ttll4, Tubulin polyglutamylase TTLL4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll4Q80UG8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ttll4Q80UG8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms