Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
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Avl9Q80U56 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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Avl9Q80U56 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Avl9Q80U56 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Avl9Q80U56 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Avl9Q80U56 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Avl9Q80U56 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Avl9Q80U56 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Avl9Q80U56 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Avl9Q80U56 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Avl9Q80U56 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Avl9Q80U56 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Avl9Q80U56 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Avl9Q80U56 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Avl9Q80U56 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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Avl9Q80U56 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Avl9Q80U56 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Avl9Q80U56 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Avl9Q80U56 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Avl9Q80U56 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Avl9Q80U56 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Avl9Q80U56 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Avl9Q80U56 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Avl9Q80U56 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Avl9Q80U56 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Avl9Q80U56 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Avl9Q80U56 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Avl9Q80U56 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Avl9Q80U56 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Avl9Q80U56 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Avl9Q80U56 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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