Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdc42bpbQ7TT50 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdc42bpbQ7TT50 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdc42bpbQ7TT50 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdc42bpbQ7TT50 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdc42bpbQ7TT50 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdc42bpbQ7TT50 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdc42bpbQ7TT50 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdc42bpbQ7TT50 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdc42bpbQ7TT50 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdc42bpbQ7TT50 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdc42bpbQ7TT50 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdc42bpbQ7TT50 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdc42bpbQ7TT50 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc42bpbQ7TT50 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc42bpbQ7TT50 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc42bpbQ7TT50 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc42bpbQ7TT50 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc42bpbQ7TT50 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc42bpbQ7TT50 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc42bpbQ7TT50 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc42bpbQ7TT50 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc42bpbQ7TT50 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc42bpbQ7TT50 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc42bpbQ7TT50 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc42bpbQ7TT50 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc42bpbQ7TT50 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc42bpbQ7TT50 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc42bpbQ7TT50 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc42bpbQ7TT50 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc42bpbQ7TT50 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc42bpbQ7TT50 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc42bpbQ7TT50 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdc42bpbQ7TT50 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdc42bpbQ7TT50 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdc42bpbQ7TT50 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdc42bpbQ7TT50 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdc42bpbQ7TT50 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdc42bpbQ7TT50 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdc42bpbQ7TT50 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdc42bpbQ7TT50 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms