Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSY8

Sgo2, Shugoshin 2, mousemouse

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Length 1,164 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo2Q7TSY8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Sgo2Q7TSY8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Sgo2Q7TSY8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Sgo2Q7TSY8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sgo2Q7TSY8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Sgo2Q7TSY8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Sgo2Q7TSY8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Sgo2Q7TSY8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sgo2Q7TSY8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms