Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSS2

Ube2q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2q1Q7TSS2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2q1Q7TSS2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2q1Q7TSS2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms