Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.43□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.42□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.41□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Dsg1cQ7TSF0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms