Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ckap2lQ7TS74 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms