Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Tnfsf18Q7TS55 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms