Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Actn1Q7TPR4 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms