Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Zfp397Q7TNK4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms