Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS8

Spop, Speckle-type POZ protein, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpopQ6ZWS8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SpopQ6ZWS8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms