Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
RfflQ6ZQM0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.08■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RfflQ6ZQM0 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms