Protein–RNA interactions for Protein: Q6YND2

Znf653, Zinc finger protein 653, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf653Q6YND2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Znf653Q6YND2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms