Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ssx9Q6XAS3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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