Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc88cQ6VGS5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms