Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUT8

Ccdc154, Coiled-coil domain-containing protein 154, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc154Q6RUT8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc154Q6RUT8 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc154Q6RUT8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc154Q6RUT8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc154Q6RUT8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc154Q6RUT8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc154Q6RUT8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc154Q6RUT8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc154Q6RUT8 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc154Q6RUT8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc154Q6RUT8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc154Q6RUT8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc154Q6RUT8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc154Q6RUT8 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms