Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGF3

Med16, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 16, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med16Q6PGF3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Med16Q6PGF3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Med16Q6PGF3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms