Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SvoplQ6PDF3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms