Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trak1Q6PD31 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trak1Q6PD31 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms