Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAQ4

Rexo4, RNA exonuclease 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo4Q6PAQ4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rexo4Q6PAQ4 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rexo4Q6PAQ4 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.5 ms