Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5D8

Smchd1, Structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smchd1Q6P5D8 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Smchd1Q6P5D8 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Smchd1Q6P5D8 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Smchd1Q6P5D8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
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