Protein–RNA interactions for Protein: Q6IUP1

Sohlh1, Spermatogenesis- and oogenesis-specific basic helix-loop-helix-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sohlh1Q6IUP1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sohlh1Q6IUP1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms