Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
CltbQ6IRU5 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
CltbQ6IRU5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms