Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
ParpbpQ6IRT3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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